Sophieskolen er en 3 sporet afdelingsopdelt skole med 3 afdelinger.
Sophieskolen er videoovervåget.
B fløjen rummer alle eleverne fra 0. klasse til og med 5. klasse.
D fløjen rummer alle eleverne fra 6. klasse til og med 7. klasse.
F fløjen rummer alle eleverne fra 8. klasse til og med 9. klasse.
Derudover rummer skolen et MOF tilbud, som er sprogtilbud til nyankomne elever med anden etnisk herkomst.
Vi har også et UC (udviklingscenter) som er et centralt visiteret tilbud til unge med forskellige udfordringer. UC organiseres og forandrer sig organisationsmæssigt hele tiden, afhængig af de elever, som befinder sig i UC.
Afdelingerne fungerer som små skoler i den store skole, men benytter fælles faglokaler, som placeringsmæssigt ligger mellem afdelingerne. Personalerne er tilknyttet en afdeling.